Мадара основал новый клан, с новым устройством, во главе клана стоял единоличный лидер, до этого лидера не было. без лидера клан был другой, новый стал лучше. Новый и старый: вот в чём разница. До этого клан был простой: сборище людей, обладающих Шаринганом, никто не посягал на власть в клане. А тут пришёл Мадара и стал отцом всех Учих, их лидером.

Простой пример:
Ты знаешь кто основал Москву? Никто не знает, кто пришёл первым на эту землю. Но 1ым провозгласил себя Юрий Долгорукий. Хотя до него Москва существовала. Тут жили племена. А до племён, какие- то ещё люди. Просто Юрий Д. пришёл и стал всё переделывать и как будто основал, но он основал новую Москву, не больше. Понимаешь в чем разница? То же самое с Мадарой.